Prieš burtų traukimą komandos buvo suskirstytos į du krepšelius:
1-ame krepšelyje: Šiaulių „Šiauliai“, Jonavos „Cbet“, Utenos „Uniclub Casino – Juventus“ ir Klaipėdos „Neptūnas“.
2-ame krepšelyje: Alytaus „Wolves“ (buvusi „Dzūkija“), Pasvalio „Pieno žvaigždės“, Kėdainių „Nevėžis-Optibet“. Taip pat į šį krepšelį pateks ir Citadele KMT atrankos nugalėtojai: Prienų „Labas GAS“ arba Gargždų „Gargždai“.
Ištraukus burtus, paaišėjo pirmojo Citadele KMT etapo A ir B grupių komandos.
A grupė:
Utenos „Uniclub Casino – Juventus“
Prienų „Labas GAS“ / Gargždų „Gargždai“
Klaipėdos „Neptūnas“
Alytaus „Wolves“
B grupė:
Jonavos „Cbet“
Kėdainių „Nevėžis-Optibet“
Šiaulių „Šiauliai“
Pasvalio „Pieno žvaigždės“
Šiose grupėse komandos žais dviejų ratų sistema (vienerias rungtynes namuose ir vienerias išvykoje). Kiekvienoje grupėje 1–2 vietas užėmusios komandos patenka į trečią etapą.
3-ąsias vietas grupėse užėmusios komandos tarpusavyje žais eliminavimo rungtynes, kurios vyks komandos 2021–2022 m. „Betsafe-LKL“ čempionate užėmusios aukštesnę vietą, aikštėje. Poros nugalėtoja pateks į trečią etapą.
Citadele KMT atrankos etapas, kuriame varžysis „Labas GAS“ ir „Gargždų“ komandos, prasidės jau spalio 4 d. Palangoje.
Pirmojo Citadele KMT etapo dvikovų pradžia numatoma 2022 m. spalio 19–20 d.
