Kandidatus gali siūlyti valstybės ar savivaldos institucijos, visuomeninės ar kitos nevyriausybinės organizacijos. Premijos nuostatai paskelbti Aplinkos ministerijos tinklapyje.
Pasiūlytus kandidatus vertins aplinkos ministro sudaryta 7 narių komisija iš mokslo, visuomeninių organizacijų ir Aplinkos ministerijos atstovų. Vadovaudamasis komisijos rekomendacijomis, sprendimą, kam skirti premiją, priims aplinkos ministras. Premija bus teikiama birželio mėnesį per Pasaulinės aplinkos dienos minėjimą.
Premijos dydis - 8 tūkst. litų.
Č. Kudabos premiją 1998 m. pelnė Dzūkijos nacionalinio parko ekologas, rašytojas Henrikas Gudavičius, 2000 m. - buvęs mokytojas Aleksandras Žalys, 2002 m. - tuometis Vilniaus universiteto Botanikos sodo direktorius Evaldas Navys ir „Tėviškės gamtos“ vyriausiasis redaktorius Juozas Stasinas, 2004 m. - televizijos žurnalistė Dalia Juočerytė ir mokytojas Valentinas Padriezas, 2006 m. - rašytojas Gediminas Isokas, 2008 m. - gamtininkas, rašytojas Selemonas Paltanavičius, 2010 m. - gamtininkas prof. Ričardas Kazlauskas.