Šiai asociacijai priklausantis žurnalas „Science“ paskelbė nepriimsiantis „Microsoft Word 2007“ biuro programų rinkiniu sukurtų dokumentų. Norintieji pateikti žurnalui medžiagą turės ją paversti „Word 2003“ ar „Word for Macintosh 2004“ programoms suprantamu formatu. Pirminei straipsnio peržiūrai dokumentą galima pateikti PDF formatu.
Tokius reikalavimus „Science“ grindžia nesuderinamumu su jau esamomis sistemomis. Iš esmės keičiantis failų formatui, 100 proc. suderinamumo būti negali. Tai patvirtina „Science“ reikalavimai, kuriuose teigiama, kad „Word 2007“ netinkamas kuriant formules turinčius dokumentus. Net ir pakeitus naująjį .docx dokumentų formatą senu .doc, šie dokumentai bus netinkami, nes įprastinė „Word 2007“ formulių rengyklė naudoja savą formulių aprašymo formatą. Keičiant dokumento formatą, formulės paverčiamos paveikslėliais. Formulėms rašyti „Science“ rekomenduoja įdiegti „MathType“ ar senesnėse „Word“ programose naudotą rengyklę.
Toks nesuderinamumas atsirado todėl, kad „Microsoft“ vėl nusprendė sukurti savą formatą. Užuot naudojusi įprastą „MathML“ formulių aprašymo kalbą, naudojamą tokiose programose kaip „Maple“ ir „Mathematica“, kompanija pasitelkė savo „Open Math Markup Language“ (OMML). OOXML dokumento apraše kompanija teigia, kad formatas buvo kuriamas siekiant paskatinti suderinamumą su kitomis programomis ir verslo sistemomis: ...enabling the implementation of the Office Open XML Formats by a wide set of tools and platforms in order to foster interoperability across office productivity applications and with line-of-business systems. Vargu ar dar vieno naujo formato, tegu ir atviro, atsiradimas padidins skirtingus formatus naudojančių sistemų suderinamumą.
Tokios pat problemos kilo ir „Nature“ žurnalui, taip pat atsisakiusiam priimti rinkmenas, pateikiamas „Office 2007“ formatu. Kaip ir „Science“, „Nature“ redaktoriai nurodo, kad šie dokumentai nesuderinami su jų naudojamomis dokumentų rengimo programomis.
„Microsoft“ teigia, kad naujasis jų dokumentų formatas yra atviras ir juo gali naudotis visi norintieji. Tačiau tai yra visiškai naujas standartas, nesuderinamas su kitomis sistemomis, išskyrus „Microsoft Office“. Jis net nėra visiškai suderinamas su senesnėmis „Microsoft Office“ versijomis.
ODF formatas, reklamuojamas IBM, „Sun Microsystems“ ir kitų ODF aljanso kompanijų, taip pat yra nauja sistema, turinti savų trūkumų. Pavyzdžiui, kaip ir daugelis kitų atvirojo kodo projektų, tai yra nuolat tobulinamas standartas, todėl jau užregistruota keletas ODF formato standarto versijų. Tačiau, kitaip nei „Microsoft“ OOXML, ODF standartas remiasi egzistuojančiais ir plačiai naudojamais standartais, pavyzdžiui, VML ar jau minėtu „MathML“.
„Microsoft“ ir toliau užsispyrusiai mano, kad dominuojanti padėtis rinkoje leidžia vienašališkai nuspręsti, kokius dokumentų formatus reikia naudoti. Kitaip tokio savos kūrybos formatų brukimo ir nepavadinsi. Prieš kelis dešimtmečius IBM manė, kad kiti kompiuterių gamintojai paseks Žydruoju milžinu ir naudos MCA ir XGA standartus. Nors šie kompiuterių standartai buvo techniškai tobuli, tačiau jie patyrė visišką fiasko.