Pasak švietimo ir mokslo ministro Gintaro Steponavičiaus, aukštojo mokslo pertvarkos kontekste iš 45 mokslo institutų Lietuvoje likus 11, pagal naują Mokslo ir studijų įstatymą yra numatytas institutų išorinis vertinimas, kuris būtų atliekamas kas šešerius metus.
„Vertinimas būtų vykdomas trimis aspektais: instituto misijos atitikimo įvertinimas, instituto veiklos kokybės analizė, atitinkamai vertinant veiklos parametrus 100 balų sistemoje, taip pat akademinės etikos ir procedūrų reikalavimų vykdymo vertinimas. Šiuos tris aspektus sudėjus į vieną visumą, būtų priimamas instituto teigiamas arba neigiamas įvertinimas“, - sakė Vyriausybės posėdyje ministras.
Patvirtintame apraše numatoma, kad vertinimo komisija kartu su argumentuotomis išvadomis gali pateikti rekomendacijas, kaip tobulinti instituto veiklą. Vertinimo komisijos išvadas per 10 darbo dienų nuo išvadų gavimo institutas gali skųsti švietimo ir mokslo ministrui. Gavęs instituto skundą dėl vertinimo komisijos išvadų švietimo ir mokslo ministras sudaro apeliacinę komisiją skundui nagrinėti.
Jei instituto veikla įvertinama neigiamai arba per nustatytą terminą institutas nepateikia veiklos programos, Švietimo ir mokslo ministerija teikia siūlymą Vyriausybei dėl instituto pertvarkymo ar pabaigos.
Dar svarstant institutų išorinio vertinimo tvarką, kai kurių mokslo institutų vadovai išreiškė būgštavimus, kad institutų programų ataskaitas kasmet vertins nebe institutų direkcija, be to, Švietimo ir mokslo ministerija neva siekianti kontroliuoti institutus ir apie jų veiklą paves spręsti ekspertų komisijai, neatsižvelgdama į mokslo institutų, tarp jų humanitarinių, lituanistinių, veiklos specifiką.
Vertinimo tvarkos apraše numatoma, kad švietimo ir mokslo ministro sprendimas teisės aktų nustatyta tvarka gali būti skundžiamas Administracinių ginčų komisijai arba teismui.