Pokario metais pradėjęs vadovauti partizaniniam pasipriešinimui, jis 1949-aisiais buvo išrinktas Lietuvos laisvės kovų sąjūdžio tarybos prezidiumo pirmininku ir faktiškai ėjo okupuotos Lietuvos prezidento pareigas.
1953 metų gegužę J.Žemaitis buvo suimtas, o kitų metų lapkričio mėnesį sušaudytas Butyrkų kalėjime Maskvoje.
Palangos miesto garbės piliečio vardas generolui bus suteiktas jo šimtmečio jubiliejaus dieną Palangoje, Gintaro muziejuje, surengtame iškilmingame kurorto tarybos posėdyje.
Miesto garbės piliečio regalijas ketinama įteikti vilnietei Ingai Staišiūnienei. Ji yra generolo neseniai mirusio sūnaus Laimučio žmonos duktė iš pirmosios santuokos.
Dvi J.Žemaičio dukterėčios Rūta Kotryna Juškaitė ir Aušra Marija Vilkienė taip pat džiaugiasi dėdei suteiktu garbės piliečio vardu.