Dėl to Lietuva prašo papildyti kai kurias PAV ataskaitos dalis
ne tik praplečiant atliktą analizę, bet ir pateikiant naujų tyrimų
duomenis bei jų įvertinimą.
Aplinkos ministro Gedimino Kazlausko teigimu, Lietuvos
pozicijoje akcentuojamos esminės grėsmės, į kurias privalo
atsižvelgti projekto rengėjai. Tai ir galimas poveikis Baltijos
jūros ekosistemai dėl sąlyčio su joje palaidota karine ginkluote
(ypač cheminiu ginklu), ir antrinė Baltijos jūros tarša dėl dugno
nuosėdų išjudinimo tiesiant dujotiekį, taip pat dujotiekio saugos
užtikrinimas ir šalių veiksmai galimų nelaimių atveju. Keliamas ir
klausimas, kas bei kaip atlygintų gamtai padarytą žalą avarijos
atveju.
Nurodoma, jog nebuvo atliktas tinkamas alternatyvių dujotiekio
trasų (tarp jų ir sausuma) parinkimas ir išsamus išnagrinėjimas.
Ataskaitoje pažymimas ir galimas neigiamas poveikis Europos
Bendrijos saugomoms teritorijoms, neigiamos pasekmės
socialinei-ekonominei aplinkai, žvejybos, turizmo ir rekreacijos
sektoriams.