Dotnuvos bažnyčios ir buvusio vienuolyno ansambliui priklausančio vienuolyno vakarinio korpuso tvarkymo darbų projektą sudaro avarijos grėsmės pašalinimo ir restauravimo darbai. Šiam projektui įgyvendinti jau skirta 625,7 tūkst. litų, iš jų didžiąją dalį - 587,7 tūkst. litų skyrė Kultūros paveldo departamentas, 38 tūkst. litų - Kėdainių rajono savivaldybė.
Prieš pradedant tvarkymo darbus XVIII a. statytas vienuolynas buvo itin prastos būklės. Dėl XX a. nugriautų dviejų korpusų, sunaikintų perdangų, daugelyje vietų suardytų pastogės konstrukcijų vakarinis vienuolyno pastatas buvo avarinės būklės - trūkinėjo skliautai, į išorę skėtėsi sienos, plėšydamos skliautų mūrą.
Šiuo metu stiprinami vienuolyno pamatai, metaliniais elementais sutvirtintos trūkinėjančios sienos. Šalinant avarijos grėsmę dar bus sutvirtinamos trūkusios skliautinės perdangos, stogo konstrukcijoje pakeičiami deformuoti ir supuvę mediniai elementai, stengiantis išlaikyti senuosius jungimo būdus ir profilius, įrengiama pamatų hidroizoliacija.
Stogas bus dengiamas čerpėmis, kurių forma būdinga baroko laikotarpiui. Numatoma užtaisyti plyšius sienų ir skliautų mūruose, įrengti prie pamatų besikaupiančio vandens surinkimo ir nutekėjimo sistemą.
Restauruojamas vienuolyno korpusas yra vienas iš Dotnuvos bažnyčios ir buvusio vienuolyno ansamblio pastatų. Žemes šio komplekso statybai dovanojo ir jo statybą fundavo didikai Bžostovskiai.
Bernardinams priklausęs vienuolynas buvo mūrinis, dviejų aukštų, keturkampio plano su kvadratiniu vidaus kiemeliu. 1842-1845 m. vienuolyno pastatai buvo remontuoti ir nežymiai perplanuoti. Vienuolynas Dotnuvoje nustojo veikti 1864 m.
Iki 1870 m. pastatai buvo nuomojami, vėliau juose veikė Nikolajaus vardo liaudies mokykla. Tik 1888 m. bažnyčia atgavo vienuolyną, tuo metu dar buvusį keturių korpusų su vidaus kiemu. Pirmojo pasaulinio karo metais nugriautas šiaurinis korpusas, o kartu su juo ir įvažiavimo į vidinį kiemą vartai. Tarpukaryje nugriautas ir pietinis korpusas. Šiuo metu vienuolyną sudaro du atskirai stovintys stačiakampio plano pastatai - buvę rytinis ir vakarinis korpusai.
Vienuolyną restauruoja UAB „Struktūra“.