Atsižvelgiant į tai, kad iki šiol tiek STT vykdoma kriminalinė žvalgyba, tiek ir ikiteisminiai tyrimai buvo organizuojami teritoriniu (apygardų) principu, nuspręsta steigti centrinį tyrimų padalinį – Centrinę tyrimų valdybą. Centrinė tyrimų valdyba vykdys veiklą tiek Vilniaus apygardos teritorijoje, tiek, atskirais atvejais, ir visoje Lietuvoje. Ši valdyba koordinuos dviejų ir daugiau STT teritorinių valdybų vykdomus tyrimus, anksčiau pranešė STT.
Tarnybai siekiant aktyviai veikti įgyvendinant Civilinio turto konfiskavimo įstatymą, aptikti tiek Lietuvoje, tiek ir užsienio valstybėse esantį galimai korupciniu būdu įgytą turtą, išaiškinti šio turto kilmę, efektyviai atskleisti tokio praturtėjimo mechanizmus, Centrinėje tyrimų valdyboje įsteigiamas Turto paieškos skyrius.
STT Centrinei tyrimų valdybai vadovaus Darius Balčiūnas, kuris nuo 2017 metų gruodžio mėnesio vadovavo Vilniaus valdybai.
