Jam mirties bausmė skirta už genocidą malšinant 1991 metų sukilimą Irake.
Sukilimas tada prasidėjo šalies pietinėje dalyje, kai JAV vadovaujamos koalicinės pajėgos Kuveite sutriuškino S. Husseino dalinius. Maištas greitai išplito ir į kitas Irako dalis, įskaitant šiaurines provincijas. Sukilėliai tikėjosi JAV paramos, tačiau jos nesulaukė.
S. Husseinui ištikimi daliniai, panaudodami sunkiąją artileriją, numalšino sukilimą. Per karinę operaciją žuvo apie 100 000 žmonių.
S. Husseinas po 24 valdžios metų buvo nuverstas 2003-iaisiais. 2006 metais jam įvykdyta mirties bausmė pakariant. Mirties nuosprendžiai paskelbti ir įvykdyti ir daugeliui buvusio diktatoriaus patikėtinių.