E.Mikaliūnas kine debiutavo būdamas šešerių. 1966 metais jis suvaidino mažąjį princą Arūno Žebriūno filme „Mažasis princas“ pagal Antoine‘o de Saint-Exupery kūrinį. Nusifilmavęs dar keturiuose filmuose, E.Mikaliūnas baigė Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje aktoriaus specialybės studijas Henriko Vancevičiaus ir Rimo Tumino vadovaujamame kurse.
Studijuodamas pradėjo vaidinti tuometiniame Valstybiniame akademiniame dramos teatre (dabar – Nacionalinis dramos teatras). Nuo 1984 metų birželio pradėjo dirbti Vilniaus teatre „Lėlė“. Šiame teatre aktorius vaidino iki pat mirties.
25 metus kūrybinio darbo metus E.Mikaliūnas praleido Vilniaus teatre „Lėlė“, per tą laiką tapo vienu pagrindinių šio teatro aktorių, nepakeičiamu svarbiausių „Lėlės“ repertuaro spektaklių dalyviu.
Sukūrė vaidmenis daugiau kaip trisdešimtyje šio teatro spektaklių, režisuotų Vitalijaus Mazūro, Laimos Lankauskaitės, Rimo Driežio, Irenos Bučienės, Algirdo Mikučio, Vytauto V. Landsbergio ir kitų: „Ką senelis padarys viskas bus gerai“ (1984), „Paštas“ (1986), „Dono Christobalio balaganėlis. Dono Perlimplino meilė“ (1986), „Raudonligė“ (1989), „Barbora Radvilaitė“ (1990), „Kelionė į pasaulio galą“ (1994), „Našlaitė Elenytė ir Joniukas aviniukas“ (1997), „Vilniaus mergelė“ (1998), „Juodoji višta“ (2001), „Princesė ir kiauliaganys“ (2001), „Trys brangenybės“ (2003) ir kituose.
Velionis bus pašarvotas balandžio 21 dieną, antradienį, 12 val. Didžiojoje teatro „Lėlė“ salėje. Karstas išnešamas balandžio 22 dieną, 11 val. E.Mikaliūnas bus palaidotas Karveliškių kapinėse.