J.Bautrėnas gimė 1925 m. sausio 15 d. Marijampolėje. 1945 m. baigė Marijampolės mokytojų seminariją, vaidino Marijampolės dramos teatre.
1947-1951 m. mokėsi Vilniaus dramos teatro studijoje, iki 1957 m. šiame teatre vaidino.
Į Lietuvos radiją ir televiziją J.Bautrėnas atėjo 1957 m. ir iki 1988 m. dirbo režisieriumi.
1997 m. jo iniciatyva įkurtas Lietuvos radijo ir televizijos muziejus.
Jis buvo vienas iš 1991 m. bado akcijos organizatorių. 2002 m. apdovanotas Sausio 13-osios atminimo medaliu.
2003 m. įkūrė Geležinio Vilko paminklo paramos fondą.
Velionis bus pašarvotas penktadienį Šv. apaštalų Petro ir Povilo bažnyčios šarvojimo salėje, lankymas nuo 15 val. Karstas išnešamas šeštadienį 14 val., laidotuvės vyks sostinės Kairėnų kapinėse.