Tomas baigė profesionalo karjerą ir rado naujos veiklos, – įkūrė interneto puslapį, skirtą dviračių sportui, sukūrė savo vardu pavadintą dviratininkų aprangos liniją „Tomas Vaitkus“.
Su fotomodeliu Gabriele Donėlaite T.Vaitkus iki vestuvių draugavo keletą metų.
T.Vaitkus turi ne vieną svarų prizą. 2000 m. pasaulio jaunimo treko čempionate pelnė sidabrą individualiame persekiojime ir auksą komandiniame persekiojime. 2001 m. Europos iki 23 metų treko čempionate iškovojo bronzą individualiame persekiojime ir sidabrą komandiniame persekiojime. 2002 m. tapo pasaulio iki 23 metų plento laiko intervalo čempionu. 2003 m. tapo Lietuvos plento laiko intervalo čempionu. 2004 m. vasaros olimpinėse žaidynėse Vaitkus dalyvavo treko varžybose. Taškų lenktynėse sportininkas nefinišavo, o komandiniame persekiojime liko 8-as.
Nuo 2005 m. aktyviai dalyvauja profesionaliose plento lenktynėse. 2006 m. laimėjo devintąjį Giro d'Italia etapą. 2008 m. tapo Ronde van het Groene Hart čempionu. 2013 m. susigrąžino Lietuvos plento čempiono titulą.
