Vienas svarbiausių naujosios LEŪA tikslų - atstovauti ekologiniams ūkiams valdžios institucijose. Numatoma sudaryti darbo grupes, kurios spręstų probleminius ekologinio žemės ūkio klausimus: sertifikavimo, paramos dydžių ir mokėjimo tvarkos, realizacijos, mokestinių lengvatų ir kt.
Ateityje LEŪA planuoja dalyvauti „Kaimo tinkle“, teikti projektus ES paramai gauti. Norima įsilieti ir į tarptautinę ekologinio žemės ūkio veiklą.
Dabar mūsų šalyje sertifikuoti 2679 ekologiniai ūkiai, kurių bendras plotas - 134,941 tūkst. hektarų.