NTAKD misija – saugoti visuomenės sveikatą, mažinti psichoaktyviųjų medžiagų pasiūlą ir paklausą, užtikrinti tarpinstitucinį koordinavimą bei atsižvelgiant į naujus iššūkius ir remiantis mokslu grįstais įrodymais dalyvauti formuojant valstybės politiką psichoaktyviųjų medžiagų pasiūlos ir paklausos mažinimo srityse. Į departamento vadovo pareigas, laimėjęs viešą konkursą, LRV nutarimu nuo 2020 m. kovo mėn. penkių metų kadencijai paskirtas prof. dr. Renaldas Čiužas.