Baltijos jūra susiduria ne tik su tarša organinėmis medžiagomis, bet ir šiukšlėmis. Dažniausiai pasitaikanti medžiaga paplūdimiuose – apie 56 procentai – yra plastikas, kuris dėl aplinkos poveikio laikui bėgant skyla į mažas daleles, kurias pašalinti iš jūros aplinkos yra išties sudėtinga ir sunkiai įgyvendinama užduotis.
Šiukšlės, patekusios į jūrą, teršia jūrų buveines ir kelia rimtų aplinkosauginių, ekonominių ir sveikatos problemų ne tik Baltijos jūros regione, bet ir visame pasaulyje. Panaši padėtis yra ir Kuršių mariose – į jas teršalai patenka ne tik iš mūsų šalies vandens telkinių, bet ir iš kaimyninės Baltarusijos.
Didelis ir buitinių nuotekų taršos poveikis gamtiniams vandenims, tačiau nemažai gyventojų vis dar nelinkę prisijungti prie centralizuotų nuotekų šalinimo tinklų ir taip prisidėti prie Baltijos jūros bei Kuršių marių apsaugos.