Antrame varžybų etape prieniškiai pateko į M grupę, kur žais su vokiečių Bonos „Telecom Basket“, austrų Obervarto „Redwell-Gunners“ ekipa ir Kipro Nikosijos APOEL. Pastaroji ekipa buvo viena iš dviejų, kuri į šį etapą pateko kaip trečiąją vietą savo grupėje praėjusiame etape laimėjusi komanda.
Varžybos startuos gruodžio 14 dieną, o klubai sužais mačus išvykoje ir namie. Iš šešių grupių pasibaigus varžyboms į atkrintamuosius mačus prasimuš po dvi geriausias komandas.
Pirmame FIBA Europos taurės turnyro etape Vytautas: iškovojo 3 pergales ir patyrė pralaimėjimą ir grupėje buvo pirmas.